2020年5月28日訊/生物谷BIOON /--當(dāng)一些人感染冠狀病毒后,他們只會(huì)出現(xiàn)輕微或無(wú)法發(fā)現(xiàn)的COVID-19病例。另一些人則會(huì)出現(xiàn)嚴(yán)重的癥狀,需要在呼吸機(jī)的幫助下掙扎數(shù)周,如果他們還能活下來(lái)的話(huà)。
盡管全球科學(xué)家共同努力,但醫(yī)生們?nèi)匀徊磺宄槭裁磿?huì)這樣。基因差異能否解釋人們?cè)?/span>COVID-19癥狀和嚴(yán)重程度上的差異?
為了驗(yàn)證這一點(diǎn),研究人員使用計(jì)算機(jī)模型來(lái)分析人類(lèi)**系統(tǒng)中已知的遺傳變異。他們的建模結(jié)果表明,事實(shí)上,人們的DNA存在差異,這可能會(huì)影響他們對(duì)SARS-CoV-2感染的反應(yīng)能力。
研究人員的研究?jī)?nèi)容
當(dāng)病毒感染人類(lèi)細(xì)胞時(shí),身體會(huì)啟動(dòng)抗病毒警報(bào)系統(tǒng)。這些警報(bào)識(shí)別病毒入侵,并告訴**系統(tǒng)發(fā)送細(xì)胞毒性T細(xì)胞(一種白細(xì)胞)來(lái)破壞受感染的細(xì)胞,希望能減緩感染。
但并不是所有的報(bào)警系統(tǒng)都是一樣的。人們有相同基因的不同版本--稱(chēng)為等位基因--其中一些等位基因?qū)δ承┎《净虿≡w比其他的更敏感。
為了測(cè)試該警報(bào)系統(tǒng)的不同等位基因是否可以解釋SARS-CoV-2**反應(yīng)的某些范圍,研究人員首先從一個(gè)在線數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索了構(gòu)成冠狀病毒的所有蛋白質(zhì)的列表。
他們隨后使用現(xiàn)有的計(jì)算機(jī)算法來(lái)預(yù)測(cè)不同版本的抗病毒警報(bào)系統(tǒng)檢測(cè)這些冠狀病毒蛋白的效果。
為什么它很重要
研究人員測(cè)試的警報(bào)系統(tǒng)部分被稱(chēng)為人類(lèi)白細(xì)胞抗原系統(tǒng),簡(jiǎn)稱(chēng)HLA。每個(gè)人都有多個(gè)構(gòu)成HLA類(lèi)型的等位基因。每個(gè)等位基因編碼一種不同的HLA蛋白質(zhì)。這些蛋白質(zhì)是警報(bào)系統(tǒng)的傳感器,通過(guò)與各種肽鏈結(jié)合來(lái)發(fā)現(xiàn)入侵者,肽鏈?zhǔn)墙M成冠狀病毒部分的蛋白質(zhì),而這些肽鏈對(duì)身體來(lái)說(shuō)是外來(lái)的。
一旦HLA蛋白與病毒或病毒片段結(jié)合,它就將入侵者運(yùn)送到細(xì)胞表面。這些"標(biāo)記"了的被感染的細(xì)胞,將被**細(xì)胞殺死。
一般來(lái)說(shuō),人的HLAs檢測(cè)到的病毒多肽越多,**反應(yīng)就越強(qiáng)。我們把它想象成報(bào)警系統(tǒng)中更靈敏的傳感器。
研究人員的建模結(jié)果預(yù)測(cè),一些HLA類(lèi)型可以結(jié)合大量的SARS-CoV-2肽,而另一些HLA類(lèi)型只能結(jié)合很少的SARS-CoV-2肽。也就是說(shuō),一些傳感器可能比其他傳感器更適合SARS-CoV-2。如果這是真的,那么一個(gè)人的HLA等位基因可能是影響其**系統(tǒng)對(duì)COVID-19**反應(yīng)的一個(gè)因素。
因?yàn)樵撗芯恐皇褂昧艘粋€(gè)計(jì)算機(jī)模型來(lái)做出這些預(yù)測(cè),他們決定使用2002-2004年SARS爆發(fā)的臨床信息來(lái)測(cè)試結(jié)果。
他們發(fā)現(xiàn)等位基因在識(shí)別SARS和SARS-CoV-2方面的有效性有相似之處。如果HLA等位基因似乎不善于識(shí)別SARS-CoV-2,那么它也不善于識(shí)別SARS。他們的分析預(yù)測(cè),一種名為B46:01的等位基因?qū)ARS-CoV-2和SARS-CoV尤其有害。可以肯定的是,先前的研究表明,攜帶這種等位基因的人比攜帶其他HLA基因的人更容易感染SARS病毒,病毒載量也更高。
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